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Reactome MCP Server

提供Reactome生物通路和系统生物学数据的访问服务，支持通路搜索、基因关联、疾病机制分析等功能。

Py Mol MCP

PyMOL-MCP通过模型上下文协议(MCP)将PyMOL与Claude AI连接，实现通过自然语言进行对话式结构生物学、分子可视化和分析。

GTEx MCP Server

一个提供GTEx（基因型-组织表达）门户API访问的模型上下文协议（MCP）服务器，支持通过25个专业工具查询和分析基因组数据。

samtools MCP

一个用于SAMtools的模型控制协议实现，提供标准化接口处理SAM/BAM/CRAM文件，支持文件格式转换、排序、索引、统计分析和合并等功能。

gget MCP

gget-mcp是一个基于Model Context Protocol (MCP)的生物信息学工具服务器，为gget生物信息学库提供标准化接口，支持基因信息检索、序列分析、蛋白质结构预测等功能，适用于基因组学研究和AI辅助生物信息学分析。

STRING-db MCP Server

一个用于访问STRING蛋白质交互数据库的MCP服务器，提供蛋白质网络分析、功能富集和比较基因组学工具。

Uniprot MCP (uniprot-mcp)

UniProt MCP Server是一个提供无缝访问UniProtKB蛋白质数据的协议服务器，支持蛋白质条目查询、序列获取、基因本体注释和ID映射等功能，专为LLM代理设计。

Evo2 MCP Server

evo2-mcp是一个基于Evo 2模型的基因组序列分析服务器，提供序列评分、嵌入、生成和变异效应预测等功能。

Bio MCP Evo2

evo2 DNA语言模型的MCP服务器，支持生成和分析DNA序列，适用于基因组研究和生物信息学应用。

Ensembl MCP

Ensembl MCP Server是一个提供访问Ensembl基因组学REST API的服务，支持基因查询、序列检索、遗传变异分析等功能。

MGnify MCP Server

一个通过模型上下文协议（MCP）暴露MGnify资源和工具的服务器。

scvi-tools MCP Server

一个基于scvi-tools的MCP服务器，用于单细胞组学数据的深度概率分析，支持自然语言交互，提供SCVI、SCANVI、TOTALVI和PEAKVI等多种工具。

Opentargets MCP

一个模型上下文协议（MCP）服务器，将Open Targets平台的GraphQL API作为一系列工具暴露出来，供Claude Desktop和其他兼容MCP的客户端使用。

Rosetta MCP Server

一个模型上下文协议（MCP）服务器，使Cursor（或任何MCP客户端）能够与Rosetta、PyRosetta和Biotite协同工作，运行RosettaScripts、验证XML协议、在Rosetta和Biotite之间进行转换、评分结构以及查询文档。

NCBI Datasets MCP Server

一个提供全面访问NCBI数据集API的模型上下文协议（MCP）服务器，支持通过31种专业工具无缝集成NCBI的基因组、分类学和生物学数据。

Mc Pymol

MCPymol是一个通过自然语言指令操作PyMOL进行蛋白质结构分析和可视化的工具，支持高级视图设置和结构探索。

Awesome Healthcare MCP

一个精选的医疗、医学和生命科学领域的MCP（Model Context Protocol）服务器列表。

Benchling MCP

为Benchling平台提供模型上下文协议（MCP）服务器，实现实验室数据管理和研究流程的标准化接口，支持AI助手与生物数据平台的交互。

Cytoscape Desktop MCP

Cytoscape MCP Server是一个嵌入在Cytoscape桌面应用中的Model Context Protocol (MCP)服务器，允许AI客户端通过HTTP连接并调用工具直接控制桌面应用，如加载网络、设置活动视图等。

Genome MCP

GenomeMCP是一个基于AI的基因组智能分析工具，通过Model Context Protocol（MCP）服务器提供实时临床基因组数据库查询、科学文献检索、群体遗传学分析和生物通路可视化功能。