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MCP 工具与服务目录

找到适合你的 MCP Server,快速完成接入

按功能、传输方式和来源整理 MCP Server,提供安装命令、配置方式、仓库与文档入口,方便你快速比较并接入合适的服务。

正式条目

87,640

可复制安装

36,828

最近生成

2026-05-22

数据服务HTTP

一个提供对蛋白质数据银行(PDB)访问的模型上下文协议(MCP)服务器,PDB是全球关于蛋白质、核酸和复杂组装体3D结构信息的存储库。

工具数量

0

GitHub Stars

24

数据服务stdio

SCMCP是一个用于单细胞RNA测序分析的自然语言处理工具,提供数据读写、预处理、工具模块、绘图和细胞间通讯分析等功能,适用于AI客户端、插件和代理框架。

安装状态

已补齐

工具数量

0

GitHub Stars

12

命令预览

pip install scmcp

数据服务stdio
Encode Toolkit logo

Encode Toolkit

encode-toolkit

ENCODE Toolkit是一个集成了14个基因组数据库访问、7个分析流程和47个工作流技能的Claude插件,用于基因组数据搜索、分析和出版物方法生成。

安装状态

已补齐

工具数量

20

GitHub Stars

34

命令预览

npx encode-toolkit

数据服务未说明

一个全面的模型上下文协议服务器,用于访问基因本体数据,支持基于本体的分析、基因注释研究和功能富集研究。

工具数量

0

GitHub Stars

8

数据服务stdio

提供对KEGG数据库的访问与生物数据分析功能的MCP服务器,支持LangChain集成和本地LLM模型。

安装状态

已补齐

工具数量

33

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8

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pip install -r requirements.txt

数据服务stdio
Ensembl MCP Server 74a1d2c7 logo

Ensembl MCP Server 74a1d2c7

@smithery/cli@latest

一个功能完整的Model Context Protocol (MCP)服务器,提供Ensembl REST API的访问,适用于基因信息查询、变异数据分析等生物信息学任务。

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已补齐

工具数量

0

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6

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npx -y @smithery/cli@latest install @effieklimi/ensembl-mcp-server --client claude --key you...

数据服务未说明

WormBase MCP Server是一个用于查询秀丽隐杆线虫和线虫基因组学的数据库服务,提供基因、蛋白质、表型等多维度数据查询功能。

工具数量

11

GitHub Stars

0

数据服务未说明

一个提供全面访问KEGG(京都基因与基因组百科全书)数据库的MCP服务器,支持通路分析、基因研究、化合物调查和跨数据库链接,适用于生物信息学、系统生物学和药物发现等领域的研究人员。

工具数量

0

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9

数据服务stdio

BioNext-MCP是一款通过自然语言对话进行生物信息学分析的智能助手,无需编程即可完成复杂分析任务。

安装状态

已补齐

工具数量

0

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8

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python --version

数据服务stdio

BioNext-MCP是一款通过自然语言交互实现无代码生物信息学分析的工具,支持单细胞RNA测序、基因组学、转录组学等多种分析类型,自动生成Python脚本并输出可视化报告。

安装状态

已补齐

工具数量

0

GitHub Stars

8

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python --version

数据服务未说明

BioThings.io MCP服务器提供对MyGene.info和MyVariant.info等生物数据API的访问,支持基因和变体注释数据的无缝集成。

工具数量

0

GitHub Stars

6

数据服务stdio

CELLxGENE Census MCP Server是一个提供单细胞RNA测序数据查询和分析的服务,支持多物种数据查询、灵活过滤和内存高效处理。

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工具数量

4

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3

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pip install -r requirements.txt

数据服务stdio

NCBI Model Context Protocol (MCP) 是一个用于与NCBI数据库交互的Python实现,支持自然语言查询和生物信息检索。

安装状态

已补齐

工具数量

14

GitHub Stars

3

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pip install -r requirements.txt

数据服务stdio

Heuris-BioMCP是一个为生命科学研究设计的生物信息学模型协议服务器,连接ChatGPT、Claude等MCP客户端与生物数据源,支持研究、转化工作流和生产审查。

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工具数量

31

GitHub Stars

1

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pip install -e .

数据服务stdio

无需安装MCP服务器即可与Galaxy生物信息学平台交互的Markdown技能文件。

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已补齐

工具数量

0

GitHub Stars

1

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pip install bioblend

数据服务未说明

BioGRID MCP服务器是一个提供基因和物理交互数据的端点服务,支持通过JSON调用获取交互网络、TSV边列表和统计分析,适用于生物信息学和机器学习应用。

工具数量

5

GitHub Stars

0

数据服务stdio

一个专业的生物信息学质量控制分析服务器,提供自动化的QC流程执行、HTML报告分析和高级数据可视化功能。

安装状态

已补齐

工具数量

10

GitHub Stars

0

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python3 -m venv venv