AACT临床试验MCP服务器
查询 抗糜蛋白酶 (ClinicalTrials.gov)数据库直接来自克劳德。使用带缓冲分页的只读SQL浏览70多个临床试验数据表,包括研究、干预措施、结果、赞助商、设施。
为什么AACT优于ClinicalTrials.gov API?
ClinicalTrials.gov API每次试验返回一条JSON记录,这对快速查找很有用,但对分析很难。想要了解2020年至2025年2期非小细胞肺癌试验的平均持续时间吗?使用API,您可以过滤试验,从每个JSON记录中提取日期,然后计算客户端的持续时间。使用AACT,这是一个SQL查询。
结构化的PostgreSQL数据库使 汇总、组合和总结 以您需要的任何方式提供临床试验数据。对于人工智能辅助分析,SQL是LLM处理得非常好的标准——与解析定制的API响应相比,错误更少,需要管理的上下文更少,性能更好,成本更低。
注: 这是一个独立的第三方集成。它不隶属于或认可 临床试验转型倡议(CTTI) 或杜克大学。然而,我们发布了CTTI关于将其数据库与Claude集成的案例研究-请参阅 AACT案例研究.
工具
| 工具 | 说明 |
|---|---|
database_info | 确认数据库连接、服务器时间和数据货币 |
list_tables | 查找所有具有近似行数的可用表 |
describe_table | 检查列名、类型、不同计数和样本值 |
get_column_values | 为具有计数的列获取不同的值——在筛选之前至关重要 |
search_columns | 在所有表中按关键字查找列(例如。 masking -> designs.masking) |
read_query | 使用缓冲结果执行SELECT、CTE或EXPLAIN查询并预览 |
fetch_rows | 浏览缓冲的查询结果,无需重新查询 |
所有表都加入 nct_id.
设置
- 在以下网址创建免费帐户https://aact.ctti-clinicaltrials.org/users/sign_up
- 安装插件(见下面的选项)
- 在系统提示时输入您的AACT凭据
安装
选项1:克劳德桌面插件(推荐)
下载最新 .mcpb 文件来自 发布 并在Claude Desktop中打开它。系统将提示您输入AACT凭据。
选项2:已发布的包
添加到您的 claude_desktop_config.json (~/Library/Application Support/Claude/claude_desktop_config.json 在macOS上, %APPDATA%\Claude\claude_desktop_config.json 在Windows上):
{
"mcpServers": {
"aact": {
"command": "uvx",
"args": ["mcp-server-aact"],
"env": {
"DB_USER": "your_username",
"DB_PASSWORD": "your_password"
}
}
}
}选项3:Docker
{
"mcpServers": {
"aact": {
"command": "docker",
"args": [
"run", "--rm", "-i",
"--env", "DB_USER=your_username",
"--env", "DB_PASSWORD=your_password",
"navisbio/mcp-server-aact:latest"
]
}
}
}选项4:来源
git clone https://github.com/navisbio/mcp-server-aact.git
cd mcp-server-aact
uv sync{
"mcpServers": {
"aact": {
"command": "uv",
"args": ["run", "--directory", "/path/to/mcp-server-aact", "mcp-server-aact"],
"env": {
"DB_USER": "your_username",
"DB_PASSWORD": "your_password"
}
}
}
}示例提示
1.竞争格局分析
“谁是阿尔茨海默病3期试验的前10名赞助商?按试验状态分列。”
服务器将发现相关表,检查阶段和状态的枚举值,然后构建一个查询连接 studies, conditions,以及 sponsors.
2.药品管道搜索
“查找pembrolizumab治疗非小细胞肺癌的所有积极招募的2期和3期试验。显示NCT ID、标题、注册和主要赞助商。”
用途 get_column_values 确认相位格式(PHASE2, PHASE3),然后查询 studies, browse_interventions,以及 conditions.
3.终点分析
“在已完成的3期2型糖尿病试验中,最常见的主要结局指标是什么?”
连接 studies 随着 outcomes 分析按结果度量类型分组的端点模式。
4.地理分布
“一个典型的罕见病试验有多少个临床试验点?按试验点数量显示排名靠前的国家。”
查询 facilities 表已连接 conditions 绘制试验地理图。
隐私
此服务器是只读的,不收集或存储任何个人数据。看 隐私.md 了解详情。
故障排除
连接或身份验证错误
- 在以下网址验证您的AACT凭据https://aact.ctti-clinicaltrials.org/users/sign_in
- AACT数据库每周进行一次维护(通常是周末)——如果连接被拒绝,请稍后重试
- 确保
DB_USER和DB_PASSWORD在配置中设置正确
spawn uvx ENOENT 错误
系统找不到 uvx.使用完整路径:
{
"mcpServers": {
"aact": {
"command": "/Users/username/.local/bin/uvx",
"args": ["mcp-server-aact"],
"env": {
"DB_USER": "your_username",
"DB_PASSWORD": "your_password"
}
}
}
}贡献
- 打开一个问题
- 电子邮件:jonas.walheim@navis-bio.com
许可证
麻省理工学院
