Systematic Literature Review
与 bensz-collect-bugs 的协作约定
- 当用户环境中出现因本 skill 设计缺陷导致的 bug 时，优先使用
bensz-collect-bugs按规范记录到~/.bensz-skills/bugs/，严禁直接修改用户本地 Claude Code / Codex 中已安装的 skill 源码。 - 若 AI 仍可通过 workaround 继续完成用户任务，应先记录 bug，再继续完成当前任务。
- 当用户明确要求“report bensz skills bugs”等公开上报动作时，调用本地
gh与bensz-collect-bugs，仅上传新增 bug 到huangwb8/bensz-bugs；不要 pull / clone 整个 bug 仓库。
定位
- 目标：在一个隔离工作目录内完成“检索 → 去重 → 评分 → 选文 → 写作 → 校验 → PDF/Word 导出”的完整综述流水线。
- 适用：用户明确要系统综述、文献综述、related work、文献调研，并希望得到 LaTeX + BibTeX + PDF/Word 产物。
- 不适用：只想补单条参考文献、只想润色已有正文、只想写普通摘要或与综述无关的文章。
- 最高原则：以最佳可用证据和写作质量完成综述；不确定时说明处理方式，不为赶进度牺牲可信度。
输入
最少需要：
{主题}：一句话主题。- 可选范围：时间、语言、研究类型、数据库偏好等。
- 档位：
Premium/Standard/Basic；未指定时读取config.yaml默认值。 - 目标字数与参考文献范围：未指定时按
config.yaml.scoring.default_*_range。 - 输出目录或安全化前缀：未指定时使用安全化主题名。
输出
默认交付以下核心文件：
{主题}_工作条件.md：输入、检索、评分、选文、结构与校验记录。{主题}_review.tex：正文唯一 LaTeX 源文件。{主题}_参考文献.bib：选中文献 BibTeX。word_budget_run{1,2,3}.csv、word_budget_final.csv、non_cited_budget.csv：综/述字数预算。{主题}_验证报告.md：字数、章节、引用一致性等验证结果。{主题}_review.pdf{主题}_review.docx
必要中间产物包括：
papers*.jsonlscored_papers.jsonlselected_papers.jsonlselection_rationale.yaml- 可选
evidence_cards_{主题}.jsonl
硬约束
- 强制导出 PDF 与 Word；只有明确失败并记录原因时才允许缺失。
- 正文字数与参考文献数必须落在当前档位范围内；可由用户覆盖，默认值以
config.yaml为准。 - 正文固定包含：摘要、引言、至少 1 个子主题段、讨论、展望、结论。
\cite{key}必须与 BibTeX key 一致；缺失即报错。- 正文禁止泄露 AI 工作流，例如“检索/去重/评分/选文/字数预算”等元叙事只能写入
{主题}_工作条件.md。 - 摘要必须为单段，避免方法学流水账；表格宽度与样式约束见
references/review-tex-section-templates.md。 - 不为凑引用而堆砌低分文献；无法确认时优先不改、不引。
主流程
0. 准备
- 记录主题、档位、字数/参考范围与输出目录。
- 开始前优先阅读：
- references/ai_query_generation_prompt.md - references/ai_scoring_prompt.md - references/expert-review-writing.md - references/review-tex-section-templates.md - 涉及翻译时再读 references/multilingual-guide.md
1. 多查询检索
- AI 为主题自主规划查询变体，通常 5-15 组。
- 优先用 OpenAlex，必要时按
config.yaml.search.provider_priority自动降级。 - 检索结果写 Search Log；resume 时若
papers路径失效，应清理后重检。
2. 去重
- 用
dedupe_papers.py生成去重结果与映射。 - 所有后续流程只读取去重后的候选集。
3. AI 评分与数据抽取
- AI 按
references/ai_scoring_prompt.md逐篇阅读标题与摘要，输出scored_papers.jsonl。 - 每篇至少包含：
score、subtopic、rationale、alignment、extraction。 - 评分范围固定为 1-10 分；仅对
>=5分文献分配子主题，避免弱相关论文污染子主题规划。 - 自检分布是否健康：高分约 20-40%，中分 40-60%，低分 10-30%。
4. 选文与 Bib 生成
select_references.py按目标参考范围和高分优先比例选出最终集合。- 生成
selected_papers.jsonl、references.bib、selection_rationale.yaml。 - Bib 清洗必须保留：大小写无关去重 key、LaTeX 特殊字符转义、缺失字段警告。
- 摘要缺失或过短的条目标记
do_not_cite，并在报告中提示摘要覆盖率风险。
5. 子主题与配额规划
- AI 基于评分结果规划 3-7 个子主题，并给出段落配额。
- 默认思路：引言约 1.5k、讨论/展望各约 1k、结论约 0.6k，其余分给子主题段。
- 结果写入工作条件与数据抽取表，作为写作锚点。
6. 字数预算
- 用
plan_word_budget.py生成 3 份预算 CSV，再汇总为word_budget_final.csv。 - 引用段与无引用段预算均需覆盖；总字数误差必须控制在
config.yaml.word_budget.tolerance内。
7. 写作
- 正文章节固定为：摘要、引言、子主题段、讨论、展望、结论。
- 写作前读取
word_budget_final.csv，按文献综/述预算组织证据。 - 默认采用单篇引用优先；引用要紧跟所支撑的观点，避免段末堆砌。
- 如需详细写作规范，直接遵循：
- references/expert-review-writing.md - references/review-tex-section-templates.md
8. 有机扩写与验证
- 若字数不足，只允许在最短或证据不足的子主题段内做增量扩写，不新增子主题，不改原主张和引用。
- 依次运行：
- validate_counts.py - validate_review_tex.py - 可选 validate_word_budget.py - generate_validation_report.py
9. 导出与多语言
- 通过
compile_latex_with_bibtex.py生成 PDF。 - 通过
convert_latex_to_word.py生成 Word。 - 如用户要求多语言版本，使用
multi_language.py翻译正文并智能编译；失败时保留错误报告与 broken 文件，并优先支持恢复备份。
工作目录与文件隔离
- 所有中间文件必须写入
{work_dir}/.systematic-literature-review/。 - 最终交付物放在工作目录根部。
- AI 临时脚本必须放到
{work_dir}/.systematic-literature-review/scripts/。 - 不要把临时文件写到工作目录根部，不要用绝对路径写
/tmp/*，也不要读写其他 run 目录。 - 以环境变量
SYSTEMATIC_LITERATURE_REVIEW_SCOPE_ROOT和SYSTEMATIC_LITERATURE_REVIEW_SCRIPTS_DIR为准。
关键命令
# 推荐主入口
python3 scripts/run_pipeline.py --topic "{主题}" --runs-root runs
# 旧入口 / resume
python3 scripts/pipeline_runner.py --topic "{主题}" --domain general --work-dir runs/{safe_topic}
python3 scripts/pipeline_runner.py --resume runs/{safe_topic}
# 阶段 3 评分后，从第 4 阶段继续
python3 scripts/pipeline_runner.py --resume runs/{safe_topic} --resume-from 4环境与脚本
- 运行环境：Python 3.9+、LaTeX（
xelatex/bibtex）、pandoc。 - 关键脚本：
- 检索：multi_query_search.py、openalex_search.py - 去重：dedupe_papers.py - 选文：select_references.py、build_reference_bib_from_papers.py - 数据抽取：update_working_conditions_data_extraction.py - 字数预算：plan_word_budget.py、validate_word_budget.py - 校验：validate_counts.py、validate_review_tex.py、generate_validation_report.py - 导出：compile_latex_with_bibtex.py、convert_latex_to_word.py
可选：成本追踪
- 初始化：
python3 systematic-literature-review/scripts/pipeline_cost.py init - 抓取定价：
python3 systematic-literature-review/scripts/pipeline_cost.py fetch-prices - 记录 token：
pipeline_cost.py log... - 汇总：
pipeline_cost.py summary - 所有成本数据写到
.systematic-literature-review/cost/
参考材料
references/ai_query_generation_prompt.mdreferences/ai_scoring_prompt.mdreferences/expert-review-writing.mdreferences/review-tex-section-templates.mdreferences/multilingual-guide.mdreferences/development-validation-guide.md