- name
- Genos基因序列分析
- description
- 使用 Genos 模型进行 DNA 序列分析。当用户提到 DNA、基因、基因组、碱基序列、ACGT 等生物信息学相关问题时使用此技能。
Genos DNA 序列分析技能
概述
此技能使用之江实验室的 Genos-1.2B 模型进行 DNA 序列分析。该模型是人类基因组基础模型，专门用于分析 DNA 碱基序列。
使用场景
- DNA 序列分析
- 基因组预测
- 碱基频率统计
- 序列模式识别
- 基因组学研究相关问题
模型信息
- 模型: Genos-1.2B
- 参数: 12 亿
- 架构: MoE (Mixture of Experts)
- 词汇量: 128 (A, C, G, T, N + 特殊标记)
- 上下文长度: 最长 1M 碱基对
使用方法
1. DNA 碱基序列分析
当用户提供 DNA 序列（如 ACGTACGT...）时，调用 analyze_dna_sequence 函数进行分析。
2. 预测下一个碱基
调用 predict_next_base 函数预测 DNA 序列中下一个可能的碱基。
3. 序列特征提取
调用 extract_sequence_features 函数提取序列的特征信息。
示例
输入格式
用户可能提供：
- DNA 序列:
ACGTACGTACGT... - FASTA 格式的基因序列
- 简单描述: "帮我分析这段 DNA 序列"
输出格式
返回分析结果，包括：
- 碱基组成统计
- 序列长度
- 预测结果
注意事项
- 此模型仅支持 DNA 碱基字符（A, C, G, T, N）
- 不支持中文或英文自然语言输入
- 输入前需去除空格、换行等非碱基字符
- 模型主要用于基因组学研究，不适用于对话任务
模型状态检查与启动
重要：在调用技能前，必须先检查模型是否已启动！
检查模型状态
模型状态记录在 ./scripts/.model_loaded 文件中（相对于项目根目录）。
- 如果文件存在且内容为
loaded，表示模型已启动 - 如果文件不存在或内容不是
loaded，需要先启动模型
启动模型
如果模型未启动，执行以下命令启动：
# 设置模型路径（可选，默认为 ./models/Genos-1___2B）
export GENOS_MODEL_PATH="./models/Genos-1___2B"
# 启动模型
python3 -c "
import sys
sys.path.insert(0, './scripts')
from genos_dna import load_model
load_model()
with open('./.model_loaded', 'w') as f:
f.write('loaded')
print('Model loaded and status saved')
"自动化检查
AI 助手在调用技能时应自动完成以下步骤：
- 检查
./.model_loaded文件是否存在且内容为loaded - 如果模型未启动，先执行上述启动命令
- 确认模型启动后再调用技能函数
使用环境变量配置
你也可以通过环境变量自定义路径：
# 设置模型路径
export GENOS_MODEL_PATH="/path/to/your/model"
# 设置状态文件路径
export GENOS_STATUS_FILE="/path/to/your/state/.model_loaded"
# 然后运行脚本
python3 your_script.py配置文件方式
你也可以创建 config.json 文件来配置路径：
{
"model_path": "./models/Genos-1___2B",
"state_file": "./scripts/.model_loaded"
}