🧠 OSDR MCP服务器+代理
此仓库演示了如何将MCP代理与自定义工具集成，以与NASA的开放科学数据存储库（OSDR）进行交互。它包括使用模型上下文协议（MCP）获取、分析和总结生物数据的代理工作流的工作示例。
📦 里面是什么
osdr_mcp/
自定义MCP服务器公开用于与OSDR数据交互的工具：
osdr_fetch_metadata：获取给定OSDR数据集的元数据osdr_find_by_organism：按生物体过滤研究- 其他工具（如RNA分析）
osdr_viz_tools
first_example/
一个使用两个官方MCP服务器的简单代理：
mcp-server-fetch（无头浏览器）mcp-server-filesystem
此代理收集信息并生成推特大小的摘要。
second_example/
类似于 first_example 但连接到 定制 MCP服务器定义于 osdr_mcp/main_simple.py.演示如何插入特定于域的工具，如OSDR元数据获取器。
third_example/
完整的多代理工作流程：
- 提取代理 –抓取OSD研究元数据
- 定量分析代理 –下载RNA计数数据并创建条形图
- 摘要编写代理 –生成总结分析的降价报告
使用自定义MCP服务器：
osdr_data_fetchosdr_viz_tools
⚙️ 配置
这 cp_agent.config.yaml 文件控件：
- LLM后端（例如Ollama、OpenAI）
- MCP服务器连接
- 工具可用性
- 系统提示/元数据
🚀 入门指南
- 克隆此仓库
- 安装依赖项：
pip install -r requirements.txt- 举个例子：
python first_example/main.py或者直接启动MCP服务器：
python osdr_mcp/main_simple.py🧩 集成说明
这种架构是为了灵活性而构建的。您可以在文档问答、RAG搜索或自定义分析工具之间切换。模式切换或UI切换是面向用户集成的理想选择。通过MCP支持基于Milvus的RAG已在路线图上。