Molecule MCP

分子MCP

分子MCP：用于分子的模型上下文协议服务器。 分子MCP通过模型上下文协议（MCP）将分子科学相关工具连接到Claude AI，使Claude能够 直接与这些工具交互并控制它们，并充当联合科学家这种集成实现了快速辅助分子建模。

Molecule MCP

安装

⚠️ 备注：Molecule MCP需要安装并运行Claude Desktop。

1. 转到Claude>设置>开发人员>编辑配置>Claude_desktop_Config.json，以包含以下内容：

{
  "mcpServers": {
    "pymol": {
      "command": "/path/to/mcp",
      "args": [
        "run",
        "/path/to/molecule-mcp/pymol_server.py"
      ]
    },
    "chimerax": {
      "command": "/path/to/mcp",
      "args": [
        "run",
        "/path/to/molecule-mcp/ChimeraX_server.py"
      ]
    },
    "gromacs_copilot": {
      "command": "/path/to/mcp",
      "args": [
        "run",
        "/path/to/molecule-mcp/mcp_server.py"
      ]
    }
  }
}

1. 安装mcp并获取脚本

pip install "mcp[cli]" chatmol
pip install git+https://github.com/ChatMol/gromacs_copilot.git # optional, for running gromacs_copilot
which mcp

将显示到mcp的路径。复制此路径以进行下一步并替换 /path/to/mcp 通往mcp的道路。

git clone https://github.com/ChatMol/molecule-mcp.git
cd molecule-mcp
pwd

将显示分子mcp的路径。复制此路径以进行下一步并替换 /path/to/molecule-mcp 通往分子mcp的道路。

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