MCP Simple Pubmed

](https://mseep.ai/app/andybrandt-mcp-simple-pubmed)

MCP简易PubMed

 ](https://smithery.ai/server/mcp-simple-pubmed)

一个MCP服务器，通过Entrez API提供对PubMed文章的访问。

特性

工具

• 搜索PubMed -使用关键字、MeSH术语、作者姓名、日期范围和布尔运算符搜索数据库
• 获取全文 -下载全文（适用于PubMed Central的开放获取文章）
• 访问摘要 -通过资源URI检索文章摘要和元数据

提示（v0.1.14中新增）

MCP Prompts可帮助您构建有效的PubMed搜索：

• 系统评价搜索 -使用MeSH术语、同义词和日期过滤器生成全面的搜索策略，以进行系统评价
• PICO搜索 -使用PICO框架构建临床问题搜索（人群、干预、比较、结果）
• 作者搜索 -查找具有正确名称格式的特定作者的所有出版物

这些提示引导人工智能构建优化的PubMed查询，使进行彻底的文献搜索变得更加容易。

备注

请注意，该工具返回XML化版本的全文。然而，它对人工智能来说比“人类可读”的文本更有用，因为它为它们提供了有关文档结构的额外信息。至少，这是克劳德3.5十四行诗所说的他更喜欢的。

另请注意，此工具和其他工具无法提供论文全文可能不是因为它不可用。在测试这个工具时，我遇到了一篇在PubMed上没有全文的论文，当Claude使用fetch访问出版物URL（我们确实通过DOI获得了）时，他确实遇到了“禁止”错误。然而，我能够使用常规浏览器访问同一页面。

换句话说，如果你的人工智能助手无法使用此工具获取论文的全文，那么值得用常规网络浏览器手动尝试。

最后，这个工具当然不能让你访问付费墙/付费论文。你可以通过你的图书馆访问来阅读它们，或者作为最后的手段，通过一个致力于免费提供公共资助研究的网站来阅读它们。

安装

通过Smithery安装

通过以下方式自动安装Simple PubMed for Claude Desktop 史密瑟里:

npx -y @smithery/cli install mcp-simple-pubmed --client claude

手动安装

pip install mcp-simple-pubmed

配置

服务器需要以下环境变量：

• PUBMED_EMAIL：您的电子邮件地址（NCBI要求）
• PUBMED_API_KEY：用于更高速率限制的可选API键

标准速率限制为每秒3个请求。没有实施速率限制，因为在典型的使用场景中，你的人工智能不太可能产生更多的流量。如果你需要它，你可以 注册API密钥 这将给你10个请求/秒。阅读关于 这在NCBI页面上.

使用Claude Desktop

添加到您的Claude Desktop配置(claude_desktop_config.json):

（Mac OS）

{
  "mcpServers": {
    "simple-pubmed": {
      "command": "python",
      "args": ["-m", "mcp_simple_pubmed"],
      "env": {
        "PUBMED_EMAIL": "your-email@example.com",
        "PUBMED_API_KEY": "your-api-key" 
      }
    }
  }
}

（Windows）

{
  "mcpServers": {
    "simple-pubmed": {
      "command": "C:\\Users\\YOUR_USERNAME\\AppData\\Local\\Programs\\Python\\Python311\\python.exe",
      "args": [
        "-m",
        "mcp_simple_pubmed"
      ],
      "env": {
        "PUBMED_EMAIL": "your-email@example.com",
        "PUBMED_API_KEY": "your-api-key" 
      }
    }
  }
}

macOS SSL证书修复

如果您在macOS上遇到SSL证书验证错误（例如 [SSL: CERTIFICATE_VERIFY_FAILED] certificate verify failed: self-signed certificate in certificate chain)，您需要安装正确的证书包：

/Applications/Python\ 3.13/Install\ Certificates.command

替换 3.13 使用您的Python版本号。这个脚本来自Python.org的Python安装。

您还可以从Finder运行它：

image

如果您在Claude Desktop打开时执行此更改，则需要退出并重新启动以使其生效。

许可证

MIT许可证