基本能力
产品定位
MCP PRIDE Archive Search Server 是一个为生物医学和蛋白质组学研究提供AI友好工具的API服务器。
核心功能
- 基于
FastMCP的MCP服务器 - PRIDE档案搜索工具,支持通过关键词、提交日期、流行度等查询数据集
- 支持
http(SSE)和stdio连接模式 - 易于扩展的附加工具
适用场景
- 蛋白质组学研究数据搜索
- 质谱数据集查询
- 生物医学数据集探索(如癌症相关)
- 查找流行或特定的蛋白质组学项目
工具列表
search_archive_tool(...):从PRIDE档案数据库中获取蛋白质组学数据集
使用教程
使用依赖
克隆仓库并安装依赖:
git clone https://github.com/PRIDE-Archive/mcp_pride_archive_search.git
cd mcp_pride_archive_search
poetry install # 或 pip install -r requirements.txt安装教程
启动MCP服务器(选择HTTP或stdio连接类型):
python -m mcp_pride_archive_search --connection_type http --port 9999调试方式
命令行参数:
| 参数 | 描述 | 默认值 |
|---|---|---|
| --connection_type | 连接类型: http或stdio | http |
| --port | 服务器运行端口(HTTP模式) | 9999 |

