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AIND元数据MCP服务器
 
MCP（模型上下文协议）服务器，通过一套全面的工具和资源提供对AIND（艾伦神经动力学研究所）元数据和数据资产的访问。
\[！警告\] 此MCP服务器已弃用。您可以继续使用它来访问V1元数据。\ 有关V2元数据，请参阅 aind数据mcp.
特性
此MCP服务器提供以下工具：
- 数据检索：使用过滤器和投影查询MongoDB集合
- 聚合：执行复杂的MongoDB聚合管道
- 模式探索：访问详细的模式示例和文档
- NWB文件访问：加载和浏览NWB（无国界神经数据）文件
- 数据摘要：生成基于人工智能的数据资产摘要
安装
如果你还没有安装uv，请按照以下步骤安装 本文档
使用uv安装MCP服务器：
uv tool install aind-metadata-mcp或者使用pip：
pip install aind-metadata-mcp配置
对于Cline（VSCode扩展）
为了确保MCP服务器在您首选的客户端中运行，您必须下载 aind-metadata-mcp 将软件包发送到您的主机。如果空间有问题，请设置 UV_CACHE_DIR 和 UV_TOOL_DIR 在继续下一步之前，请先前往有容量的地点。
- 更简单的安装版本
跑 uv tool install aind-metadata-mcp 在您的终端上，继续下面的配置MCP客户端。
- 如果上述步骤不起作用：
在IDE中使用python 3.11创建虚拟环境
# Instructions for Conda
conda create -n python=3.11
conda activate
# Instructions for virtual environment
py -3.11 -m venv .venv
# Windows startup
.venv\Scripts\Activate.ps1
# Mac/ Linux startup
source .venv/bin/activate 在IDE终端中运行以下命令。
pip install uv
uvx aind-metadata-mcp如果一切顺利，你会看到以下通知- Starting MCP server 'aind_data_access' with transport 'stdio'-，你应该为你选择的客户做好准备！
光标IDE
- 安装MCP服务器：
uv tool install aind-metadata-mcp- 创建MCP配置文件：
mkdir -p ~/.cursor- 创建
~/.cursor/mcp.json内容如下：
{
"mcpServers": {
"aind-data-access": {
"command": "aind-metadata-mcp",
"args": [],
"env": {}
}
}
}- 重要：替换
aind-metadata-mcp如果需要，可以使用完整路径：
which aind-metadata-mcp使用完整路径（例如。， /Users/username/.local/bin/aind-metadata-mcp)在 command 现场。
- 完全重新启动游标（Cmd+Q然后重新打开）
备注：Cursor使用与VSCode不同的MCP配置系统。配置必须在 ~/.cursor/mcp.json，不在主settings.json文件中。
MCP客户端使用说明
用于在客户端中添加MCP服务器的JSON配置文件的结构应如下
{
"mcpServers": {
}
}将以下行插入到mcpServers字典中
"aind_data_access": {
"disabled": false,
"timeout": 300,
"type": "stdio",
"command": "aind-metadata-mcp"
}请注意，配置JSON文件后，服务器将需要几分钟的时间才能在客户端中填充。
Claude桌面应用程序
- 单击屏幕左上角的三行。
- 文件>设置>开发人员>编辑配置
VSCode中的Cline
- 确保Cline已下载到VScode
- 单击Cline窗口右上角的三个堆叠矩形
- 已安装>配置MCP服务器
- 关闭并重新打开VSCode
VSCode中的Github副本
- 命令面板（ctrl-shift p）
- 搜索MCP：添加服务器
- 选择
Manual Install/stdio - 当系统提示输入命令时，输入
uvx aind-data-access - 命名您的服务器
- 关闭并重新打开VSCode
- 在Copilot聊天->选择代理模式->单击三个堆叠的矩形以配置工具
- 为了使代理能够使用AIND API的上下文进行回复，您必须手动添加此存储库中的.txt文件（在资源下）
用于Code Ocean
- 找到 以下胶囊，使用预装的aind元数据mcp启动Cline和Co-pilot。
- 请参阅 代码海洋MCP服务器 获得额外支持
- 引脚版本4.2或4.5